单位工程施工组织设计是以单位工程（如一栋楼房、一个烟囱 、一段道路、一座桥等）为对象编制的，在施工组织总设计的指导下，由直接组织施工的单位根据施工图设计进行编制，用以直接指导单位工程的施工活动，是施工单位编制分部（分项）工程施工组织设计和季、月、旬施工计划的依据。综合楼工程属于该公司承接的整体工程项目中的一个单位工程，因此，为了指导该单位工程的施工活动，应编制单位工程施工组织设计。故选B。