1996年4月，国务院在总结“两江”试点的基础上，又选择了 58个城市扩大医疗保险制度改革试点，从而使改革试点遍及全国的29个省、自治区、直辖市，社会统筹与个人账户相结合的医疗保险制度初步形成。 
1998年12月，国务院在继续总结试点经验的基础上，提出了《关于建立城镇职工基本医疗保险制度的决定》，开始建立城镇职工基本医疗保险制度。 
到2000年前后，全国绝大多数地区完成了医疗保险制度改革方案的组织实施，标志着新制度在全国基本建立。 
截至2007年，我国城镇职工基本医疗保险的覆盖范围已遍及机关事业单位和大多数企业，并扩大到城镇个体经济组织、灵活就业人员、农民工和被征地农民。