中级人民法院管辖的第一审行政案件有：（1）确认发明专利权案件和海关处理的案件；（2）对国务院各部门或省、自治区、直辖市政府具体行政行为提起诉讼的案件；（3）本辖区内重大、复杂的案件，选项BD不符合。

        确认发明专利权的行政案件主要有三种：一是关于是否授予发明可权案件；二是关于宣告授予的发明专利权无效或维持发明专利权的案件；三是关于实施专利强制许可的案件。这类案件之所以要由中级人民法院管辖，主要是因为确认发明专利权是一项专业性、技术性很强的业务，需要较高的科技和法律水平。 选项A，不属于以上三种情况。

       海关处理的案件主要是指由海关处理的纳税案件和有关因违反海关法而被海关采取强制措施或予以处罚的行政案件。这类案件由中级人民法院管辖的主要理由是：其一，海关大多设置在大中城市，职权范围与中级人民法院基本吻合；其二，海关的业务与政策要求较高，由中级人民法院管辖，可以保证办案质量。选项C符合题意。

故本题选C。