排序法的缺点也是存在的，主要表现在以下几个方面：
（1）职位顺序排列上无任何理论基础，只依靠评估者的主观判断，很难达成评价上的客观性，缺少说服力。
（2）不精确，只能得出职位高低顺序，却难以判断两个相邻职位之间实际差距的大小，无法进一步解释评估后的结果，也无法说明各职位间重要性的差异程度。
（3）当有新职位产生或增加时，难以与当初的排列规律和标准相匹配。因而无法将新职位适当地插入原有的职位顺序之中，必须将所有的职位再重新进行一次评价。