1、甲公司的行为构成骗取贷款罪，骗取贷款罪和贷款诈骗罪的区别表现在：

（1）骗取贷款罪的行为人打算日后归还贷款，而贷款诈骗罪则是以非法占有为目的，行为人根本不打算归还贷款。由于甲公司日后归还了一部分贷款，只不过因经营不善无法全部归还，因而并非以非法占有为目的。

（2）骗取贷款罪的犯罪主体是单位和自然人，而贷款诈骗罪的犯罪主体只能是自然人。甲公司骗取贷款800万元用于经营，因经营不善导致500万元贷款无法归还，甲公司构成骗取贷款罪。

2、根据《刑法》规定，单位犯骗取贷款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依据骗取贷款罪处罚。据此，选D项。

3、甲公司董事长乙是甲公司的法定代表人，而法定代表人的行为就是法人的行为，因而，不存在共同犯罪的问题，故不选A、B、C项。