在没有通过《法院组织法》之前，南京国民政府仿照北洋政府实行四级三审制，但1935年《法院组织法》施行之后，南京国民政府仿照德国、日本等国家实行三级三审制。可见，A项表述错误，选A项。
南京国民政府最高法院审理的上诉案件，进行法律审，即仅仅审查法律适用是否正确，而不进行事实审理。可见，B项表述错误，选B项。

省、特别区和直辖市设高等法院，审理一审上诉和抗告案件，以及“内乱”、“外患”、“妨害国交”等罪的第一审案件。可见，C项表述错误，选C项。
南京国民政府实行审检合署，检察院设置于法院之内，D项表述正确。