《预防未成年人犯罪法》第三十六条规定：家庭、学校应当关心、爱护在工读学校就读的未成年人，尊重他们的人格尊严，不得体罚、虐待和歧视。工读学校毕业的未成年人在升学、就业等方面，同普通学校毕业的学生享有同等的权利，任何单位和个人不得歧视。题干中，张晓分数较高，但是周老师却因为张晓有过在专门学校（即工读学校）就读的经历，于是将其做了退档处理，其做法是不合法的，侵犯了张晓的平等升学权。本题选D项。