在总体复核阶段执行分析程序，所进行的比较和使用的手段与风险评估程序中使用的分析程序基本相同，（B正确）但两者的目的不同。

在总体复核阶段实施的分析程序主要在于强调并解释财务报表项目自上个会计期间以来发生的重大变化（D正确），以证实财务报表中列报的所有信息与注册会计师对被审计单位及其环境的了解一致，与注册会计师取得的审计证据一致。因为在总体复核阶段实施的分析程序并非为了对特定账户余额和披露提供实质性的保证水平（C错误），因此并不如实质性分析程序那样详细和具体，而往往集中在财务报表层次（A正确）。C项表述不正确，故答案为C。