由题意知，企业采用移动加权平均法计算发出材料成本，所以需要逐步计算每次购入材料时的移动加权平均单位成本。 

4月1日，甲材料结存300千克，每千克实际成本为3元，所以该日甲材料的移动加权平均单位成本为3元；

4月3日，发出甲材料100千克，发出甲材料成本=3×100=300（元）；

4月12日，购入甲材料200千克，每千克实际成本10元，所以该日甲材料的移动加权平均单位成本=[（300-100）×3+200×10]÷（300-100+200）=6.5（元）；

4月27日，发出甲材料350千克，发出甲材料成本=6.5×350=2275（元）； 

4月末该企业甲材料结存成本=300×3-300+200×10-2275=325（元），或4月末该企业甲材料结存成本= （300-100+200-350）×6.5=325（元），选项D正确。